Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích využívá systém bioWEs pro management experimentálních dat a metadat v rámci Ústavu komplexních systémů, Fakulty rybářství a ochrany vod. Systém je využíván pro uchovávání dat dohromady s popisem experimentu a pro spolupráci v rámci ústavu a spolupráci se zahraničními partnery. bioWES slouží k managementu dat v oblasti časo-sběrné mikroskopie a výzkumu automatizovaných systémů monitorujících chování ryb a raků.

Systém je využíván od roku 2014 jako testovací pracoviště, které spolupracuje na jeho vylepšování. Díky systému bioWES je možné dohledat informace o měřených a zpracovaných datech, což zefektivňuje celý výzkum a zajišťuje reprodukovatelnost výsledků.